Výjimečný kurs v Groningenu

Název kursu by se dal přeložit nejspíš jako "(Možnosti) zlepšení nemocniční surveillance a rychlé diagnostiky kriticky důležitých patogenů sekvenováním metagenomu" (Enhancing Hospital Surveillance and Rapid Diagnostics of Critical Pathogens Through Metagenomics Sequencing). Uzávěrka přihlášek je do pátku 14. listopadu a registrační stránka dnes ukazuje ještě 13 volných míst (minulý týden to bylo 25). Kurs je třídenní - dva dny jsou přednáškové a třetí den jsou praktická cvičení - jak získat z metagenomových dat informace užitečné pro diagnostiku a surveiilance (Extracting useful Information from Metagenomics Data for Diagnostics and Surveillance). Kompletní informace o kursu na https://events.escmid.org/event/198. Absolvování celého kursu na místě (v UMC Groningen) je samozřejmě nákladné - 500 Euro (navíc je přístupný jen púro členy ESCMID), ale dá se přihlásit i k on-line účasti za 150 Euro - ta se ovšem bohužel týká jen přednášek první dva dny.

A proč kurs považuji za výjimečný? O rychlé diagnostice patogenů na základě analýzy sekvencí "přečtených" přímo z klinického vzorku (metagenom cell-free DNA, příp. DNA po nějaké formě extrakce) se na konferencích mluví už nějakou dobu, na tomto kursu je ale možné si "vytěžení" takové informace přímo osahat a navíc se poučit ze zkušeností vynikajících řečníků. Zcela nově (alespoň z mé zkušenosti) se pak v podobě kursu nabízí získání zkušeností s analýzou šíření patogenů a plazmidů v nemocničním prostředí na opět na základě sekvenování metagenomu ze směsných vzorků z prostředí...